Den nye ISO-standard møder modstand, da både FSC og PEFC mener, at den vil skabe mere forvirring end klarhed i markedet, og at standarden skaber unødig bureaukrati. Det nuværende system, der inkluderer FSC og PEFC, og som er bredt accepteret og anerkendte i markedet, er langt mere fleksibelt, og systemerne tillader, at virksomheder med lethed kan være certificeret efter begge ordninger uden betydeligt ekstra arbejde eller omkostninger. Desuden har begge certificeringssystemer en lang tradition for inkludering af stakeholders i udviklingen af standarder igennem en multikammerstruktur.
Begge ordninger frygter, at udviklingen af en ISO-standard vil underminere denne åbne struktur, hvor virksomheder og NGO’er har fuld indflydelse på udviklingen af standarder, og at den vil medføre yderligere krav til certificerede virksomheder, som FSC og PEFC ikke finder nødvendige.
I et fælles brev til ISO-medlemmer udtrykker FSC og PEFC deres fælles modstand overfor forslaget. Download brevet nedenfor.